cyto_dl.utils package

Subpackages

• cyto_dl.utils.spharm package
  • Submodules
    • cyto_dl.utils.spharm.reconstruction module
    • cyto_dl.utils.spharm.rotation module

Submodules

• cyto_dl.utils.arg_checking module
  • get_dtype()
• cyto_dl.utils.array module
  • create_dataloader()
  • extract_array_predictions()
• cyto_dl.utils.checkpoint module
  • load_checkpoint()
• cyto_dl.utils.config module
  • is_config()
  • kv_to_dict()
  • remove_aux_key()
• cyto_dl.utils.download_test_data module
  • delete_test_data()
  • download_test_data()
  • parse_s3_path()
  • setup_paths()
• cyto_dl.utils.dummy_dataset module
  • DummyDatamodule
    • DummyDatamodule.get_dataloader()
    • DummyDatamodule.predict_dataloader()
    • DummyDatamodule.test_dataloader()
    • DummyDatamodule.train_dataloader()
    • DummyDatamodule.val_dataloader()
  • DummyDataset
    • DummyDataset.generate_img()
• cyto_dl.utils.pylogger module
  • get_pylogger()
• cyto_dl.utils.rich_utils module
  • enforce_tags()
  • print_config_tree()
• cyto_dl.utils.rotation module
  • RotationModule
    • RotationModule.compute_rotation_matrix()
  • get_rotation_matrix_so2()
  • get_rotation_matrix_so3()
• cyto_dl.utils.template_utils module
  • close_loggers()
  • extras()
  • get_metric_value()
  • instantiate_callbacks()
  • instantiate_loggers()
  • log_hyperparameters()
  • save_file()
  • task_wrapper()