aicsimageio

• aicsimageio package
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    • aicsimageio.metadata package
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      • aicsimageio.metadata.utils module
      • Module contents
    • aicsimageio.readers package
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      • aicsimageio.readers.array_like_reader module
      • aicsimageio.readers.bfio_reader module
      • aicsimageio.readers.bioformats_reader module
      • aicsimageio.readers.czi_reader module
      • aicsimageio.readers.default_reader module
      • aicsimageio.readers.dv_reader module
      • aicsimageio.readers.lif_reader module
      • aicsimageio.readers.nd2_reader module
      • aicsimageio.readers.ome_tiff_reader module
      • aicsimageio.readers.ome_zarr_reader module
      • aicsimageio.readers.reader module
      • aicsimageio.readers.tiff_glob_reader module
      • aicsimageio.readers.tiff_reader module
      • Module contents
    • aicsimageio.utils package
      • Submodules
      • aicsimageio.utils.io_utils module
      • Module contents
    • aicsimageio.writers package
      • Submodules
      • aicsimageio.writers.ome_tiff_writer module
      • aicsimageio.writers.ome_zarr_writer module
      • aicsimageio.writers.timeseries_writer module
      • aicsimageio.writers.two_d_writer module
      • aicsimageio.writers.writer module
      • Module contents
  • Submodules
  • aicsimageio.aics_image module
    • AICSImage
      • AICSImage.ReaderClass
      • AICSImage.SUPPORTED_READERS
      • AICSImage.channel_names
      • AICSImage.current_scene
      • AICSImage.current_scene_index
      • AICSImage.dask_data
      • AICSImage.data
      • AICSImage.determine_reader()
      • AICSImage.dims
      • AICSImage.dtype
      • AICSImage.get_dask_stack()
      • AICSImage.get_image_dask_data()
      • AICSImage.get_image_data()
      • AICSImage.get_mosaic_tile_position()
      • AICSImage.get_mosaic_tile_positions()
      • AICSImage.get_stack()
      • AICSImage.get_xarray_dask_stack()
      • AICSImage.get_xarray_stack()
      • AICSImage.metadata
      • AICSImage.mosaic_tile_dims
      • AICSImage.ome_metadata
      • AICSImage.physical_pixel_sizes
      • AICSImage.reader
      • AICSImage.reader_path
      • AICSImage.reader_paths
      • AICSImage.save()
      • AICSImage.scenes
      • AICSImage.set_scene()
      • AICSImage.shape
      • AICSImage.xarray_dask_data
      • AICSImage.xarray_data
    • imread()
    • imread_dask()
    • imread_xarray()
    • imread_xarray_dask()
  • aicsimageio.constants module
  • aicsimageio.dimensions module
    • DimensionNames
      • DimensionNames.Channel
      • DimensionNames.MosaicTile
      • DimensionNames.Samples
      • DimensionNames.SpatialX
      • DimensionNames.SpatialY
      • DimensionNames.SpatialZ
      • DimensionNames.Time
    • Dimensions
      • Dimensions.items()
      • Dimensions.order
      • Dimensions.shape
  • aicsimageio.exceptions module
    • ConflictingArgumentsError
    • InvalidDimensionOrderingError
    • UnexpectedShapeError
    • UnsupportedFileFormatError
  • aicsimageio.formats module
  • aicsimageio.image_container module
    • ImageContainer
      • ImageContainer.channel_names
      • ImageContainer.current_scene
      • ImageContainer.current_scene_index
      • ImageContainer.dask_data
      • ImageContainer.data
      • ImageContainer.dims
      • ImageContainer.dtype
      • ImageContainer.get_image_dask_data()
      • ImageContainer.get_image_data()
      • ImageContainer.metadata
      • ImageContainer.physical_pixel_sizes
      • ImageContainer.scenes
      • ImageContainer.set_scene()
      • ImageContainer.shape
      • ImageContainer.xarray_dask_data
      • ImageContainer.xarray_data
  • aicsimageio.transforms module
    • generate_stack()
    • reduce_to_slice()
    • reshape_data()
    • transpose_to_dims()
  • aicsimageio.types module
    • PhysicalPixelSizes
      • PhysicalPixelSizes.X
      • PhysicalPixelSizes.Y
      • PhysicalPixelSizes.Z
  • Module contents
    • get_module_version()